L'église Saint-Pierre d'Assise a été fondée avec le monastère au Xe siècle par les bénédictins du mont Subasio à une époque d'expansion *stratégique* de l'Ordre. Au début du XIIIe siècle. il a été reconstruit selon un design roman-gothique particulier. La fa'ade rectangulaire construite avec la pierre rose typique du mont Subasio. est ponctuée de trois portails. comme de nombreuses rosaces et deux bandes divisées par un cadre avec des arcs suspendus. Le portail central est flanqué de deux lions. Il a été consacré par le pape Innocent IV en 1253. L'intérieur. restauré en 1954. a trois nefs séparées par des pilastres. avec un presbytère surélevé. une abside semi-circulaire et un dôme. Les monuments funéraires des aristocrates d'Assise des XIIIe et XIVe siècles se trouvent sur la contre-fa'ade et les côtés du presbytère. tandis que sur les murs et dans les chapelles il ya des peintures de la même période. Une caractéristique principale. autant qu'elle peut sembler non pertinente. est qu'elle n'appartient pas à l'Ordre franciscain.